Năm 2020, theo định hướng phát triển Khoa học - công nghệ trong giai đoạn mới, Học viện Nông nghiệp Việt Nam tái thiết và thành lập được 36 nhóm nghiên cứu mạnh.
Năm 2019, Học viện Nông nghiệp Việt Nam tiếp tục triển khai đề án thí điểm thành lập các nhóm nghiên cứu mạnh tại 14 khoa của Học viện. Hiện nay, Học viện đã thành lập 50 nhóm nghiên cứu mạnh, trong đó: Lĩnh vực nông học (11 nhóm nghiên cứu); Chăn nuôi - Thú y- Thủy sản (13 nhóm nghiên cứu); Cơ điện (2 nhóm nghiên cứu); Công nghệ thông tin (1 nhóm nghiên cứu mạnh); Công nghệ sinh học (9 nhóm nghiên cứu); Công nghệ thực phẩm ( 2 nhóm nghiên cứu); Kinh tế - xã hội (7 nhóm nghiên cứu); Tai nguyên và Môi trường ( 4 nhóm nghiên cứu); Sư phạm ngoại ngữ ( 1 nhóm nghiên cứu)
Căn cứ vào định hướng phát triển Khoa học và Công nghệ của Học viện Nông nghiệp Việt Nam; Với mục đích thúc đẩy hoạt động khoa học - công nghệ tại Học viện, được sự chỉ đạo của Đảng ủy và Ban Lãnh đạo của Học viện, Ban Khoa học và Công nghệ cùng với các đơn vị thành lập 49 nhóm nghiên cứu mạnh bao hàm tất cả các lĩnh vực như nông học, thú y, chăn nuôi, cơ điện, công nghệ thực phẩm, công nghệ sinh học… tại 14 khoa của Học viện.